Ülseratif kolitte, bağırsaklardaki mukoza tabakasında iltihap gelişir. Bu iltihap, rektumda başlar ve kalın bağırsağın yukarı doğru ilerler.

Bağırsakların herhangi bir bölümünde, genellikle ince bağırsağın son kısmı ve kalın bağırsağı içeren sindirim sistemini etkiler. Crohn hastalığı, kalıcı bir iltihaplanma ile karakterizedir.

Çoğu kolon polipi kansere dönüşmez, ancak bazı polipler zaman içinde kansere dönüşebilir. Bu nedenle, kolon poliplerinin erken teşhisi ve yönetimi önemlidir.

Kalın bağırsağın iç duvarında oluşan, kör bir tüp veya keseciğe benzeyen küçük çıkıntılardır. Divertikülit, bu keselerin iltihaplanması, enfekte olması veya yırtılması durumunda ortaya çıkar.